Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms