Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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