Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdcQ9QW08 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms