Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Dkk3Q9QUN9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Dkk3Q9QUN9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Dkk3Q9QUN9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Dkk3Q9QUN9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms