Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms