Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclk1Q9JLM8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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