Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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CubnQ9JLB4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms