Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ms4a4bQ9ES61 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ms4a4bQ9ES61 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ms4a4bQ9ES61 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms