Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms