Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hmg20aQ9DC33 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hmg20aQ9DC33 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hmg20aQ9DC33 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hmg20aQ9DC33 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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