Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syde1Q9DBZ9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms