Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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