Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms