Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TrmuQ9DAT5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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TrmuQ9DAT5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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TrmuQ9DAT5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TrmuQ9DAT5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms