Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms