Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms