Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms