Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms