Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms