Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifi35Q9D8C4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifi35Q9D8C4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms