Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn22Q9D7U6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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