Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tube1Q9D6T1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms