Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms