Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms