Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms