Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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