Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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