Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms