Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms