Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zbed3Q9D0L1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zbed3Q9D0L1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed3Q9D0L1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed3Q9D0L1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed3Q9D0L1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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