Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms