Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmem39aQ9CYC3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmem39aQ9CYC3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmem39aQ9CYC3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmem39aQ9CYC3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmem39aQ9CYC3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem39aQ9CYC3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem39aQ9CYC3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem39aQ9CYC3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem39aQ9CYC3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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