Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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