Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CWU4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CWU4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms