Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg12Q9CQY1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms