Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms