Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PsenenQ9CQR7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms