Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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