Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Nicn1Q9CQM0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms