Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms