Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms