Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms