Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms