Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpa3Q9CQ71 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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