Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms