Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms