Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms