Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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