Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms