Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms